1月1日 内蒙古农业大学子弟小学更名为内蒙古农业大学附属小学，实行民办公助办学体制。
1月10日 我校被授予“全区高等教育自学考试先进集体”的称号。
1月12日至22日 王林和副校长赴日本国与岗山大学、鸟取大学开展合作研究，与高知大学就建立校际合作关系达成意向。
1月15日 职业技术学院被国家劳动和社会保障部、 自治区劳动厅确定为职业技能鉴定所和技术等级定点培训单位。
1月21日 我校“三讲”教育领导小组成立。
1月21日 自治区人民政府副主席宝音德力格尔视察职业技术学院。
1月25日 国家新闻出版署[2000]91号文件批复， 同意《内蒙古林学院学报》（社科版）更名为《内蒙古农业大学学报》（社科版）。
1月 计算机与信息工程系主任裴喜春教授受聘为教育部全国农林院校计算机教育与现代教育技术教学指导委员会委员,并任计算机学科组副组长；农业部全国农业院校教学指导委员会学科组成员；全国高等学校现代化教育技术研究会专家组成员。
2月16日 杨士英被评为全区精神文明建设先进工作者。
2月18日 校党委召开扩大会议,研究部署“三讲”教育工作。
2月19日至23日 日本国岗山大学总务部部长山崎辅洋来校访问。并签订《内蒙古农业大学与岗山大学间的合作协定》。
2月21日至3月9日 学校领导班子成员和处级以上领导干部举办以“讲学习、讲政治、讲正气”为主要内容的党性党风教育学习班。
3月1日 内蒙古农业大学与苏尼特右旗签订科教兴旗发展区域经济示范协议书。
3月2日 乔光华被自治区世界银行借款扶贫项目领导小组评为1999年度世界银行贷款扶贫项目先导工程先进个人。
3月2日 我校召开1999年度社会治安综合治理表彰会。
3月8日至15日 以国际粮农组织蒙古办事处都格尔扎布为团长的调研组来我校考察。
3月12日 内蒙古农业大学与呼和浩特科技文化村签署协议，并正式加入开发建设科技文化联合体。
3月13日至26日 蒙古国国立农业大学代表团来我校访问。
3月21日 “内蒙古农业大学与日本国岗山大学校际合作协议”和“内蒙古农业大学与日本国岗山大学留学生交流实施细则”签字仪式在学校举行
3月24日 自治区人民政府副主席郝益东主持召开主席办公会议，听取内蒙古农业大学职业技术学院专题汇报，形成主席办公会议纪要。
3月31日 自治区人民政府副主席郝益东出席在学校召开的“内蒙古自治区可持续农业发展项目”讨论会并会见项目资助方负责人加拿大农业部草原司GERALD LUCIUK先生。
3月 由香港方树福堂基金会捐资100万元人民币建设的学校“树华电子智源中心”建成并投入运行。
3月 内蒙古农业大学被呼和浩特市大学西路社会治安综合治理委员会评为1999年度“社会治安综合治理先进单位”。
4月1日 中国与加拿大政府间合作、由内蒙古农业大学承担的“内蒙古可持续农业发展项目”正式启动。
4月1日 法国农科院贝特朗.埃尔维厄院长一行来我校访问。
4月3日 内蒙古农业大学校徽设计方案正式确定。
4月9日 法国农业科学院动物研究中心FRANSOIS MENISSIER(梅尼西)主任先后回访了学校。
4月11日 我校召开“三讲”教育工作总结大会。
4月12日 我校举行建校一周年万人升国旗仪式。
4月26日 内蒙古农业大学被呼市卫生局授予2000年度“食品卫生先进集体”。
4月27日 我校再次调整实验室，将58个实验室整合为39个。
4月29日 我校邀请有关学科专家教授举行西部大开发专家座谈会。
4月30日 奈民夫研究员获“全国先进工作者”称号。
4月 林业工程学院被劳动部确定为职业技术鉴定中心OSTA 信息高新技术考试站。
4月 内蒙古农业大学被呼和浩特市新城区防火委员会评为1999 年度“防火工作先进单位”。
4月 内蒙古农业大学网络中心落成并正式投入运行。
5月4日 98级园艺甲班被评为“优秀青年集体标兵”。
5月23日 河南商丘司法局文工团来校举行司法之光“三五”普法教育专题文艺演出。
5月24日 国家教育部高教司钟秉林司长、 《中国高等教育》副主编一行来我校考察工作。
5月26日 校团委举行共青团“五四”系列表彰大会。22 个优秀团支部、187名优秀团员受到表彰。
5月28日 自治区人民政府副主席郝益东来校会见加拿大国际开发署高级官员沃廉.莱德考普一行4人，双方就加拿大援助“内蒙古可持续农业发展项目”进行会谈。
5月30日至6月2日 云南农业大学党委书记刘维光等一行3人来学校参观考察。
5月31日 内蒙古农业大学侨台联小组成立。
6月8日 自治区党委副书记、人民政府主席云布龙率领政府秘书长韩志然、科技厅厅长乌兰巴特尔、畜牧厅厅长于铁夫、农业厅副厅长尚金荣、教育厅副厅长阿荣等，来校视察工作并为职业技术学院举行的挂牌仪式，还与学院师生一起参加植树劳动。
6月14日 由《人民日报》、《光明日报》、中央电视台等8家新闻单位组成的中央新闻单位采访团对学校进行采访。
6月15日 自治区党委决定（内党干字2000-233号）:包赛音任内蒙古农业大学党委副书记；于洋不再担任任内蒙古农业大学党委副书记职务；李畅游任内蒙古农业大学党委委员；嘎尔迪不再担任内蒙古农业大学党委委员职务。
6月15日 自治区党委决定(内党干字2000-234号)提名：李畅游任内蒙古农业大学副校长；嘎尔迪不再担任内蒙古农业大学副校长职务；郭连生不再担任内蒙古农业大学巡视员职务；陈宽厚不再担任内蒙古农业大学助理巡视员职务。
6月22日 我校举办第一届青年教师教学技能竞赛。评出一等奖3名，二等奖8名。
6月27日 自治区人民政府内政发[2000]64号令决定:李畅游任内蒙古农业大学副校长；免嘎尔迪内蒙古农业大学副校长职务；免郭连生内蒙古家业大学巡视员职务；免陈宽厚内蒙古农业大学助理巡视员职务。
6月27日 我校召开首次学生工作会议。表彰12 名学生工作先进工作者，提出《内蒙古农业大学关于加强和改进学生工作的意见》、《内蒙古农业大学关于学生工作干部队伍建设的意见》。
6月27日 动物营养专业王洪荣的博士学位论文─“生长绵羊限制氨基酸和理想氨基酸模式的研究”被教育部评为2000年全国优秀博士学位论文。
6月30日 校党委召开纪念建党79周年暨表彰大会，对4个先进党总支、21个先进党支部、74 名优秀共产党员、25名优秀党务工作者进行表彰，并举行新党员集体宣誓仪式。
6月 内蒙古农业大学思科网络技术学院成立。
6月 内蒙古农业大学获全区大学生田径运动会团体总分第一名。
6月 内蒙古农业大学被国务院学位办批准为首批招收农业推广硕士、兽医推广硕士单位。
7月5日 2000年全区学生暑期“三下乡”大中专社会实践活动出征仪式在学校举行。自治区人大副主任陈瑞清、自治区及有关部门的领导出席出征仪式。
7月5日 我校“博士生服务团”赴锡林郭勒盟苏尼特右旗开展科技服务活动。该团被中宣部、教育部、团中央、全国学联授予“全国优秀博士服务团”称号。
7月6日 内蒙古农业大学被教育部评为认真贯彻《学校体育工作条例》优秀普通高等学校。
7月7日 我校毕业学生1528名，其中，博士研究生2名，硕士研究生52名，本科生1222名，专科生253名。
7月10日 40 名优秀应届大学毕业生被自治区党委组织部选调到基层工作。
7月11日 国务院批准姚云峰、郭凤祥享受1999 年度政府特殊津贴。
7月19日 内蒙古农业大学专家数据库建成。
7月24日 共青团中央书记处第一书记周强专程来到呼和浩特市赛罕区碾格图村，视察学校动物科学与医学学院大学生开展“三下乡”活动的情况。
是年，学校被中宣部、教育部、团中央评为中国大中专学生志愿者暑期“三下乡”社会实践活动先进单位，被自治区党委宣传部、教育厅、团委评为“1999年全区大中专学生‘三下乡’优秀组织单位”。
7月27日 麻硕士校长与日本国东京大学农学部部长林良博签订《内蒙古农业大学与东京大学农业生命科学研究院间的校际学术交流协定书》。
7月28日 内蒙古农业大学教学督导委员会正式成立。
7月31日至8月2日 “全国家具协会秘书长工作会议”在我校召开。
8月1日 林业工程学院被劳动部确定为职业技术鉴定中心OSTA 信息高新技术考试站。
8月1日 国务院学位委员会农业工程学科评议组副组长、华南农业大学副校长罗锡文教授应邀在学校在机电工程学院指导工作，并作了两场专题学术报告。
8月2日 内蒙古农业大学与内蒙古森工集团签订校企合作意向书。
8月4至6日 中国畜牧兽医学会动物解剖学、组织学、胚胎学分会第十一次全国会员代表大会暨学术讨论会在学校召开。
8月7日至10日 日本国岐阜大学校长金城俊夫一行来校访问，并签订《内蒙古农业大学与岐阜大学间的学术交流协定书》。
8月7日至13日 日本国鸟取大学工学部教授林农一行来校访问。
8月17日至9月9日 日本国鸟取大学教授玉井重信来校访问。
8月18日至20日 机电工程学院举行建院四十周年庆典，自治区人民政府副主席宝音德力格尔题词：“院龄四十年，人才遍内蒙”，并发来贺信。中国工程学院院士汪懋华教授应邀参加庆典，并在开幕式上发表讲话。
8月20日至9月18日 校党委副书记任一峰、副校长李畅游一行访问加拿大农业部草原管理局、旱作农业研究中心、灌溉研究中心、林业研究中心，并讨论中加双方的合作事宜。同时访问加拿大里贾纳大学及萨期喀彻温大学，就校际交流与合作事宜草签合作协议。
8月22日至9月12日 学校邀请冈山大学吉川贤和宫本拓教授来校对“沙生植物特性测定技术和搅拌型酸牛奶的开发”引进项目进行技术指导及讲学
8月28日 国家科教领导小组办公室专职副主任李主其一行在自治区党委副秘书长吴永刚的陪同下视察职业技术学院。
8月30日 自治区人民政府副主席郝益东、自治区畜牧厅厅长于铁夫及有关部门的负责同志，就自治区畜牧业连续10年取得丰收等问题与学校专家教授进行座谈。
8月 受内蒙古自治区发展计划委员会委托，学校承担“内蒙古风沙区生态环境治理工程项目建议书”的编制任务。该项目是国家实施西部大开发生态建设重点项目之一。
8月 学校获自治区优秀青年科技标兵集体奖1项、杰出青年科技标兵1名、青年科技标兵12名、青年知识分子优秀科技成果奖6项。校团委获优秀组织奖。
9月1日 学生公寓从学校行政管理系统中分离出来，组建服务实体。
9月5日 自治区党委常委、组织部长杨利民在自治区党委高校工委书记、教育厅厅长张树逊等有关部门领导的陪同下，对学校“三讲”教育及“回头看”情况进行调研座谈。
9月5日至14日 学校邀请法国农科院专家 Fransais Menissier 和Christain Legault教授对“肉牛育种体系的建立和高瘦肉率种猪品系的建立”引进项目进行技术指导及讲学。
9月6日 张翠萍被授予“全国优秀工会工作者”称号。
9月10日 我校对第一批学成回校工作的7 位博士给予每人1万元安家费及一套三室一厅住房奖励；奖给以同等学历获硕士学位的3名教师每人4500元培养费。
9月11日至16日 “融商杯”国际女子网球卫星赛在学校举行。
9月13日 日本岗山大学宫本先生应邀来学校进行学术讲座。
9月18日至25日 我校党委举办处级以上干部“三个代表”重要思想学习班。
9月22日 中国建设银行内蒙古自治区分行与内蒙古农业大学全面合作协议签字仪式在学校举行。
9月22日 我国当代著名书画家、 上海交通大学东方艺术交流中心陈英明、陈培两位教授将历时数月精心创作的四幅山水画精品捐赠学校。
9月22日 工会开展“四争一创”即“争当先进分会、 争当先进工会小组、争当优秀工会干部、争当优秀工会积极分子和创模范职工之家”评比表彰活动，评出先进分会7个，先进工会小组30个，优秀工会干部50名， 优秀工会积极分子44名。
9月22日 内蒙古农业大学与盘古集团结成教学科研产业一体化合作关系。自治区人民政府副主席宝音德力格尔及有关部门负责同志出席签字仪式
9月23日至10月6日 校党委书记云荣布扎木苏一行访问法国农科院，签订《内蒙古农业大学与法国农科院间进行交流与合作的协定书》。
9月25日 我校召开思想政治教育研究会成立暨2000年研讨会。 通过学校思想政治教育研究会章程，选举产生理事、常务理事、会长、副会长、秘书长、副秘书长。
9月26日 中国共产党优秀党员、老红军、原内蒙古林学院党委书记、 院长、副省级离休干部刘复初同志病医逝，享年90岁。
9月27日 自治区人大常委会教科文卫委员会、自治区法制局、 档案局组成的联合检查团对学校执行《档案法》和《内蒙古自治区档案条例》情况进行检查。
9月30日 西部开发助学金发放仪式在学校举行。自治区党委常委、宣传部部长张国民及有关部门负责同志出席仪式。
9月 内蒙古农业大学录取新生3352名。其中，少数民族875名，占24.1%。新生中，博士研究生19名,硕士研究生113名，本科生2397名，专科生823名。
9月 云锦凤同志被自治区教育工会授予“自治区三育人先进个人”称号。
10月10日 续维国编审的《英美两家‘百年老刊’给予我们的启示》的论文被美国柯尔比科学文化信息中心评为2000年优秀科学论文, 获得进入全球互联网络进行世界范围交流资格。
10月12日 内蒙古农业大学与亿利集团正式签订“内蒙古杭锦旗库布齐沙漠综合治理规划委托协议书”。
10月16日 内蒙古农业大学获呼和浩特地区大学生男子排球赛第三名。
10月21日 内蒙古农业大学与和林格尔县签定“科技兴县”协议。
10月 在全区第六届社会科学优秀成果评选中，我校获一等奖1项，二等奖2项，青年奖1项，优秀奖3项。
11月1日 内蒙古农业大学第一次学生代表大会召开。
11月1日 由自治区政协副主席、自治区依法治区领导小组副组长格日勒图同志带领的自治区普法依法治区检查验收组来校检查验收“三五”普法及依法治理启动阶段的工作情况。
11月2日 自治区人民政府批准田德、裴喜春、 云兴福为自治区有突出贡献中青年专家。
11月3日 我校“信息管理与信息系统”、“工业设计”、“资源环境与城乡规划管理”、“水产养殖”等专业被批准为新增本科专业。
11月10日 内蒙古农业大学获呼和浩特地区大学生女子篮球赛冠军。
11月11日 我校教学成果奖评选结束，评出一等奖11项，二等奖10项。
11月16日 内蒙古农业大学被评为1999年全区工资统计、干部统计先进单位，郗福兵被评为工资统计先进个人。
11月17日 生物工程系与内蒙古盘古集团签订联合进行“转基因保鲜、抗病河套蜜瓜新品种培育”科技开发合同。
11月19日 内蒙古自治区人民政府内政土补[2000]4号，学校征收土右旗北什轴乡海流村525 公顷实验用地获《建设用地批准书》。
11月20日至27日 蒙古国国立农业大学校长钢?宝力道一行来校访问。
11月22日 自治区人民政府确定学校为国债专项资金资助单位。
11月25日至12月20日 内蒙古农业大学党校举办了第一期青年教工党员培训班。
11月25日 我校实施《学生公寓改革方案》，成立学生公寓服务中心，启动企业化经营管理。
11月27日 我校成立“内蒙古自治区沙生灌木资源利用研究会”。
11月28日 自治区残联在学校举行扶困助残捐助仪式。自治区人民政府副主席周维德及有关部门负责同志出席捐助仪式。
11月28日 我校图书馆流通部局域网正式开通。
11月28日 我校档案馆成为全区高校首家晋升国家一级档案管理的单位。
11月29日 中国和加拿大合作“内蒙古可持续农业发展项目”第二次洽谈会在我校举行。
11月29日 2000年度全区高校共青团工作责任目标考核调研组来校考核调研。
11月 校党委开展征集“最佳党日活动”设计方案活动。
11月 云锦凤教授被自治区妇联授予自治区“三八红旗手”称号。
12月1日 我校教学牧场转制为呼和浩特市伊德尔乳业有限责任公司。
12月4日 职业技术学院季晓岚被自治区教育厅评为全区语言文字使用情况调查先进个人。
12月5日 中国科学院副院长陈宣瑜院士率中科院考察团一行14 人来校考察。
12月5日 内蒙古农业大学与日本国宇都宫大学鉴定了《内蒙古农业大学与日本国宇都宫大学学术交流协议书》。
12月8日 林业工程学院木材学实验室成为内蒙古自治区产品检验所木材检验分包实验室。
12月10日至30日 校纪委组织“处级领导班子及成员廉政建设责任目标”完成情况考核测评。
12月12日 经济管理学院资料室及闫文、段瑞梅分别获内蒙古自治区普通高等学校院系（所）资料室先进集体和先进个人称号。
12月15日至31日 我校邀请美国怀俄明大学Richardz.Mccormicr教授来校对“牛羊肉保鲜储运”引进项目进行技术指导及讲学。
12月15日 内蒙古农业大学被自治区教育厅评为1999-2000年度维护高校稳定，完成社会治安综合治理工作先进单位。
12月15日 我校《畜牧一级学科建设的探索与实践》等4项教学改革成果被评为自治区教学成果一等奖，并被自治区推荐参评国家级教学成果奖；《教学管理体制改革的研究与实践》等7项教学改革成果被评为二等奖。
12月15日 我校召开1999-2000学年三好学生、优秀学生干部表彰大会。390名“三好学生”、251名“优秀学生干部”受到表彰。
12月22日 内蒙古农业大学被自治区国家保密局评为全区“三五”保密法制宣传教育先进单位。
12月28日 经国务院学位委员会第十八次会议审议通过，学校畜牧学被列为博士学位授权一级学科；农业机械化工程、动物遗传育种与繁殖、水土保持与荒漠化防治被列为博士点；水文学及水资源、森林工程、食品科学、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、林木遗传育种、森林经理学被列为硕士点。
12月28日 国家教育部部长陈至立在自治区党委副书记、人民政府代主席乌云其木格、副主席宝音德力格尔等陪同下，来校视察。
12月29日 体育教学部潘海波、杨静、刘延荣被授予自治区高校“优秀体育教师”称号。
12月，由李博生主持研究的“抗旱增产复合剂”通过鉴定,并获国家发明专利证书。
12月 在内蒙古新闻出版局和内蒙古报业协会组织的全区报纸印刷质量评比中，《内蒙古农业大学报》印刷质量达到优质级。
校团委被自治区团委授予“全区五四红旗团委”称号和“科技创新优秀奖”、“基层组织建设优秀奖”。
职业技术学院被自治区人民政府评为“自治区级安全小区”。
学校列入各级各类科技计划项目74项，落实项目经费766万元。
我校被中宣部、教育部、共青团中央评为中国大中专学生志愿者署期“三下乡”社会实践活动“先进单位”。
2000年我校获国家基金资助项目创历年最好水平。申报国家基金项目82项中有19项科研项目获得资助,受资项目总经费226.34万。
1月 职业技术学院首批3栋职工住宅楼竣工。
1月15日 自治区劳动厅厅长王维山等一行5人来职业技术学院授“国家职业技术鉴定所，技术培训等级定点单位”两块匾牌。
1月18日 内蒙古农业大学职业技术学院被命名为自治区级文明学校。
1月21日 自治区人民政府副主席宝音德力格尔来职业技术学院视察，并决定为职业技术学院建设实验楼。
2月14日 自治区人民政府副主席宝音德力格尔主持召开主席办公会议。会议确定为职业技术学院建设5,000平方米图书馆。
3月24日 自治区人民政府副主席郝益东主持召开主席办公会议。会议听取职业技术学院专题汇报，研究中 、加、内蒙古可持续农业发展项目，并形成会议纪要。
4月27日 内蒙古农业大学批复职业技术学院机构设置：党委办公室、院长办公室、教务处、学生工作处、总务处、工程系、经管系、基础部、信息管理系、生物技术系、园区准处级单位和4个直属科级单位。
5月27日 职业技术学院承办“2000年呼和浩特地区大中专学校珠算技术比赛大会”。职院一队获团体第1名。
6月8日 自治区党委副书记、自治区人民政府主席云布龙来职业技术学院视察，并为内蒙古农业大学职业技术学院挂牌。有关厅局及农大主要领导出席挂牌仪式。
7月 李畅游、张诚、葛茂悦“试论高职实践课程体系的建设”被评为1999年度全国农技高师优秀教学改革成果一等奖，获中国职教学会农技高师教育工会联名颁发荣誉证书。
8月24日 国务院科教领导小组办公室副主任李主其、自治区党委副秘书长吴永刚视察职业技术学院。
9月19日 经专家评议，内蒙古教育厅研究决定，推荐职业技术学院为国家支持第二批示范性职业技术学院建设的学校。
12月4日 季晓岚被评为“全区语言文字使用情况调查先进个人”。
12月15日 李畅游、葛茂悦、郑云胜、郭奇斌、郝拉柱、王燕茹“高等职业技术教育人才培养模式的研究”荣获自治区高等教育教学成果一等奖。
是年，李畅游被选为中国职业教育学会农技高师教委、工委常务理事会副理事长。
是年，职业技术学院获自治区安全小区称号。
