一九六六年（原农牧学院）

1月6日 自治区农业厅将五原良种繁殖场移交内蒙古农牧学院。

2月26日 内蒙古农牧学院派出由20名教师、80名学生组成的2支兽医医疗队，分赴呼伦贝尔盟、伊克昭盟，深入牧区协助当地防治家畜疾病，开展教学与科研活动。

4月2日 内蒙古农牧学院调整部分机构，建立院生产委员会；基础部并入教务处；马列主义教研室的农经教研组划归基础部。

5月1日至6月8日 内蒙古农牧学院接待了法国、日本、澳大利亚、智利等11个国家的21位外宾参观。

6月 内蒙古农牧学院畜牧系草原专业招收4名越南留学生。

6月 “文化大革命”开始波及内蒙古农牧学院。

8月15日 内蒙古农牧学院召集各系筹委会、筹委会筹备人员开会，研究建立院筹委会。

8月16日 内蒙古农牧学院揪出部分院、系领导及教师，列为黑邦，此后，不断有人遭受揪斗。

8月19日 内蒙古农牧学院召开筹委会委员会、常委会；22日，筹委会公章被砸毁；23日，筹委会办公室被封。此后，各红卫兵总部纷纷成立。

12月13日 内蒙古农牧学院6个红卫兵总部封存原筹委会存的材料；15日晚召开全院平反大会，给25名干部、学生平反。

一九六六年（原林学院）

3月14日 自治区党委组织部（66）组任字054号文件通知，苏林任内蒙古林学院党委书记；免去程尚贤内蒙古林学院党委书记职务。

5月 院党委组织全院师生批判“三家村”。

院党委传达中央对“文化大革命”的指示，成立文化大革命办公室，郝秀林任主任。

6月 月初，全院停课开展“文化大革命”。月中，全面停课，各项工作陷入混乱、停顿状态。

8月 中旬，内蒙地区大规模揪斗老干部，林学院一些人开始揪斗院领导和部分环节干部。下旬，群众组织开始出现。

9月 林学院毕业生181名。

10月 林学院开展所谓“批判资产阶级反动路线”的斗争。各种名称的战斗队纷纷成立。